Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm2A2A7B5 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm2A2A7B5 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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