Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Homer1Q9Z2Y3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Homer1Q9Z2Y3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms