Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hdac5Q9Z2V6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hdac5Q9Z2V6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hdac5Q9Z2V6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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