Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd1Q9Z2E2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd1Q9Z2E2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd1Q9Z2E2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms