Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdpk1Q9Z2A0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdpk1Q9Z2A0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms