Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccne2Q9Z238 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccne2Q9Z238 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms