Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip6Q9Z1Y4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trip6Q9Z1Y4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trip6Q9Z1Y4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms