Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NgfrQ9Z0W1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NgfrQ9Z0W1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms