Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Xpr1Q9Z0U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xpr1Q9Z0U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Xpr1Q9Z0U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 474.1 ms