Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip2Q9Z0H8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clip2Q9Z0H8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip2Q9Z0H8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms