Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms