Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VapaQ9WV55 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapaQ9WV55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VapaQ9WV55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VapaQ9WV55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VapaQ9WV55 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms