Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArcQ9WV31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ArcQ9WV31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms