Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mixl1Q9WUI0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mixl1Q9WUI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mixl1Q9WUI0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms