Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcsQ9WU84 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms