Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd6ipQ9WU78 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd6ipQ9WU78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms