Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp1Q9WTX5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp1Q9WTX5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms