Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkraQ9WTX2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkraQ9WTX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms