Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2l3Q9WTM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms