Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam50bQ9WTJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fam50bQ9WTJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam50bQ9WTJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam50bQ9WTJ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms