Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc2Q9R244 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc2Q9R244 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc2Q9R244 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms