Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psmb3Q9R1P1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb3Q9R1P1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms