Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Htra1Q9R118 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htra1Q9R118 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms