Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpxQ9R0M3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpxQ9R0M3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms