Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav3Q9R0C8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav3Q9R0C8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms