Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BcamQ9R069 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BcamQ9R069 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcamQ9R069 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms