Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk3Q9QZL0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk3Q9QZL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk3Q9QZL0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms