Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn8Q9QZ49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn8Q9QZ49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn8Q9QZ49 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms