Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf1Q9QZ09 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phtf1Q9QZ09 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phtf1Q9QZ09 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms