Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic4Q9QYB1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic4Q9QYB1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic4Q9QYB1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms