Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp1Q9QY53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp1Q9QY53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp1Q9QY53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms