Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb11Q9QY30 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms