Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Opn4Q9QXZ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms