Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc7a8Q9QXW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc7a8Q9QXW9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc7a8Q9QXW9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms