Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354bQ9QXT9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354bQ9QXT9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms