Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Homer2Q9QWW1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Homer2Q9QWW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Homer2Q9QWW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms