Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1aQ9QWF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Chaf1aQ9QWF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms