Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rabgef1Q9JM13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rabgef1Q9JM13 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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