Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh9a1Q9JLJ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms