Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SacsQ9JLC8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SacsQ9JLC8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms