Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prg3Q9JL95 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prg3Q9JL95 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms