Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gde1Q9JL56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms