Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc5a3Q9JKZ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc5a3Q9JKZ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc5a3Q9JKZ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms