Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upk3aQ9JKX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upk3aQ9JKX8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upk3aQ9JKX8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.2 ms