Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arl6ip1Q9JKW0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arl6ip1Q9JKW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arl6ip1Q9JKW0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arl6ip1Q9JKW0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arl6ip1Q9JKW0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl6ip1Q9JKW0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms