Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp39a1Q9JKJ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms