Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.2 ms