Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem1Q9JKE2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem1Q9JKE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms