Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3glb1Q9JK48 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3glb1Q9JK48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms