Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl3Q9JJR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl3Q9JJR7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ascl3Q9JJR7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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